Cette page décrit comment sont stockées les informations visibles dans les écrans de l'application.

Série de campagnes

Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Nom

X

Texte libre

Program.name (PROGRAM.NAME)

Zone

X

Liste.

Provenant d'un référentiel des zones d'études des campagnes halieutiques.

Program.locations (PROGRAM2LOCATION.LOCATION_FK)

Description

X

Texte libre

Program.description (PROGRAM.DESCRIPTION)

Campagne

Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Série

X

Liste.

Choix parmi les séries de campagne existantes dans la base.

ScientificCruise.program (SCIENTIFIC_CRUISE.PROGRAM_FK)

Série partielle

 

Texte libre

ScientificCruise.fishingTrip.surveyMeasurement (SURVEY_MEASUREMENT.ALPHA_NUMERICAL_VALUE, avec PMFM_FK=<PmfmId.SURVEY_PART>)

Name

 

 

ScientificCruise.name (SCIENTIFIC_CRUISE.NAME)

Nombre de poches

X

Numérique

En lecture

récupération de la plus grande valeur dans ScientificCruise.fishingTrip.gearPhysicalFeatures.gearPhysicalMeasurement.numericalvalue (GEAR_PHYSICAL_MEASURMENT.NUMERICAL_VALUE avec PMFM_FK=<PMFM_ID_MULTIRIG_NUMBER>)

En écriture

valeur dupliquée pour chaque engin (voir "Engin(s)" ci-dessous) dans ScientificCruise.fishingTrip.gearPhysicalFeatures.gearPhysicalMeasurement.numericalvalue (GEAR_PHYSICAL_MEASURMENT.NUMERICAL_VALUE avec PMFM_FK=<PMFM_ID_MULTIRIG_NUMBER>)

Port de départ

X

Liste.

Choix parmi une liste finie provenant d'un référentiel d'Harmonie.

ScientificCruise.fishingTrip.departureLocation (FISHING_TRIP.DEPARTURE_LOCATION_FK) avec le lien avec la campagne via SCIENTIFIC_CRUISE_FK)

Port d'arrivée

X

Liste.

Choix parmi une liste finie provenant d'un référentiel d'Harmonie.

ScientificCruise.fishingTrip.returnLocation (FISHING_TRIP.RETURN_LOCATION_FK) avec le lien avec la campagne via SCIENTIFIC_CRUISE_FK)

Date de début

X

Date (JJ/MM/AAAA)

ScientificCruise.departureDateTime (SCIENTIFIC_CRUISE.DEPARTURE_DATE_TIME)

Heure de début

X

Heure (HH:MM)

Date de fin

X

Date (JJ/MM/AAAA)

ScientificCruise.returnDateTime (SCIENTIFIC_CRUISE.RETURN_DATE_TIME)

Heure de fin

X

Heure (HH:MM)

Navire

X

Liste.

Choix parmi les navires existants en base

ScientificCruise.vessel (SCIENTIFIC_CRUISE.VESSEL_FK)

Engin(s)

X

Liste.

Fonctionnement via le principe de la double liste. Les éléments sont à sélectionner parmi la première liste, et sont ajoutés dans la seconde liste à leur sélection.

ScientificCruise.fishingTrip.gearPhysicalFeatures.gear (GEAR_PHYSICAL_FEATURES.GEAR_FK avec RANK_ORDER=<n° d'ordre dans la liste>)

Chef(s) de mission

X

Liste.

Fonctionnement via le principe de la double liste. Les éléments sont à sélectionner parmi la première liste, et sont ajoutés dans la seconde liste à leur sélection.

La première personne de la liste est stockée sous ScientificCruise.manager (SCIENTIFIC_CRUISE.MANAGER_PERSON_FK) Pour les autres personnes, ScientificCruise.fishingTrip.vesselPersonFeatures avec un VesselPersonRole.id=<responsable_de_campagne>

Responsable(s) de salle de tri

X

Liste.

Fonctionnement via le principe de la double liste. Les éléments sont à sélectionner parmi la première liste, et sont ajoutés dans la seconde liste à leur sélection.

ScientificCruise.fishingTrip.vesselPersonFeatures avec un VesselPersonRole.id=<responsable_salle_de_tri>

Commentaire

 

Texte libre

ScientificCruise.comments (SCIENTIFIC_CRUISE.COMMENTS)

Protocole

Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Nom

X

Texte libre

TuttiProtocol.name (persisté dans le fichier)

Commentaire

 

Texte libre

TuttiProtocol.comment (persisté dans le fichier)

Protocoles - Caractéristiques

Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Classes de taille

 

Liste.

Fonctionnement via le principe de la double liste. Les éléments sont à sélectionner parmi la première liste, et sont ajoutés dans la seconde liste à leur sélection.

On récupère la liste de tous les pmfm que l'on répartit dans les différents onglets. Chaque pmfm ne peut être sélectionné que dans une seule liste.

Mise en œuvre de l'engin

 

Liste.

Fonctionnement via le principe de la double liste. Les éléments sont à sélectionner parmi la première liste, et sont ajoutés dans la seconde liste à leur sélection.

Observations individuelles

 

Liste.

Fonctionnement via le principe de la double liste. Les éléments sont à sélectionner parmi la première liste, et sont ajoutés dans la seconde liste à leur sélection.

Autres caractéristiques

 

Liste.

Fonctionnement via le principe de la double liste. Les éléments sont à sélectionner parmi la première liste, et sont ajoutés dans la seconde liste à leur sélection.

Espèces

Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Espèce sélectionné

 

Liste

La liste des espèces référent non encore utilisés.  Note: cette liste est partagée sur les deux onglets espèces - benthos).

Tableau

Espèce

 

Lecture seule

Chaque ligne du tableau est stockée sous la forme d'un SpeciesProtocol : TuttiProtocol.species.

Code campagne

 

Texte libre

Mode de mensuration

 

Liste

Pesée

 

Booléen (Case à cocher)

Dénombrement

 

Booléen (Case à cocher)

Class Tri.

 

Booléen (Case à cocher)

Sexe

 

Booléen (Case à cocher)

Maturité

 

Booléen (Case à cocher)

Age

 

Booléen (Case à cocher)

Prélèvement de pièces calcaires

 

Booléen (Case à cocher)

Benthos

Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Espèce sélectionné

 

Liste

La liste des espèces référent non encore utilisés.  Note: cette liste est partagée sur les deux onglets espèces - benthos).

Tableau

Espèce

 

Lecture seule

Chaque ligne du tableau est stockée sous la forme d'un SpeciesProtocol : TuttiProtocol.species.

Code campagne

 

Texte libre

Mode de mensuration

 

Liste

Pesée

 

Booléen (Case à cocher)

Dénombrement

 

Booléen (Case à cocher)

Class Tri.

 

Booléen (Case à cocher)

Sexe

 

Booléen (Case à cocher)

Maturité

 

Booléen (Case à cocher)

Age

 

Booléen (Case à cocher)

Prélèvement de pièces calcaires

 

Booléen (Case à cocher)

Trait

Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Code Station

X

Texte libre

Operation.vesselUseFeatures.vesselUseMeasurement (VESSEL_USE_MEASUREMENT.ALPHANUMERICAL_VALUE avec PMFM_FK=<PmfmId.STATION_NUMBER>)

Numéro de Trait

X

Numérique

Operation.name (OPERATION.NAME) : ajouté à la fin du "name", derrière le code de l'engin, pour rester compatible avec le format des données historiques.

Numéro de poche

 

Numérique

Liste des poches observées Operation.gearUseFeatures.gearUseMeasurement (GEAR_USE_MEASUREMENT.ALPHANUMERICAL_VALUE avec PMFM_FK=<PmfmId.MULTIRIG_AGGREGATION>)

Strate

 

Liste.

Les valeurs de ce champ sont issues d'un référentiel.

Operation.gearUseFeatures.fishingArea.regulationLocation (FISHING_AREA2REG_LOCATION.LOCATION_FK associé au FISHING_AREA de l'opération) En lecture : sélection en tant que localité à partir du locationLevel (LOCATION.LOCATION_LEVEL_FK=<LocationLevelId.SCIENTIFIC_CRUISE_STRATA>)

Sous strate

 

Liste.

Les valeurs de ce champ sont issues d'un référentiel.

Operation.gearUseFeatures.fishingArea.regulationLocation (FISHING_AREA2REG_LOCATION.LOCATION_FK associé au FISHING_AREA de l'opération) En lecture : sélection en tant que localité à partir du locationLevel (LOCATION.LOCATION_LEVEL_FK=<LocationLevelId.SCIENTIFIC_CRUISE_SUB_STRATA>)

Localité

 

Liste.

Les valeurs de ce champ sont issues d'un référentiel.

operation.gearUseFeatures.fishingArea.regulationLocation (FISHING_AREA2REG_LOCATION.LOCATION_FK associé au FISHING_AREA de l'opération) En lecture : sélection en tant que localité à partir du locationLevel (LOCATION.LOCATION_LEVEL_FK=<LocationLevelId.SCIENTIFIC_CRUISE_LOCALITE>)

Latitude et Longitude de début de traîne

 

Cordonnées.

Le format de saisie peut être modifié dans la configuration.

Operation.vesselPosition (VESSEL_POSITION.LATITUDE et VESSEL_POSITION.LONGITUDE), avec startDateTime = "Début de traine > Date et heure"

Latitude et Longitude de fin de traîne

 

Cordonnées.

Le format de saisie peut être modifié dans la configuration.

Operation.vesselPosition (VESSEL_POSITION.LATITUDE et VESSEL_POSITION.LONGITUDE), avec startDateTime = "Fin de traine > Date et heure"

Date de début de traîne

X

Date (JJ/MM/AAAA)

Operation.startDateTime et Operation.fishingStartDateTime (OPERATION.START_DATE_TIME et OPERATION.FISHING_START_DATE_TIME)

Heure de début de traîne

 

Heure (HH:MM)

Date de fin de traîne

 

Date (JJ/MM/AAAA)

Operation.endDateTime et Operation.fishingEndDateTime (OPERATION.END_DATE_TIME et OPERATION.FISHING_END_DATE_TIME)

Heure de fin de traîne

 

Heure (HH:MM)

Trait rectiligne

 

Booléen (Case à cocher)

Operation.vesselUseFeatures.vesselUseMeasurement (VESSEL_USE_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId.RECTILINEAR_OPERATION>)

Distance chalutée

 

Numérique

Operation.vesselUseFeatures.vesselUseMeasurement (VESSEL_USE_MEASUREMENT.NUMERICAL_VALUE avec PMFM_FK=<PmfmId.TRAWL_DISTANCE>)

Durée

 

Numérique (Lecture seule)

Non stockée en base

Trait valide/invalide

 

Booléen (Case à cocher)

Operation.vesselUseFeatures.vesselUseMeasurement (VESSEL_USE_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId.HAUL_VALID>)

Saisisseur(s)

 

Liste.

Fonctionnement via le principe de la double liste. Les éléments sont à sélectionner parmi la première liste, et sont ajoutés dans la seconde liste à leur sélection.

Operation.vesselPersonFeatures avec un VesselPersonRole.id=<responsable_de_campagne>

Autres caractéristiques > Navire

 

Lecture seule

Identique à celui de la campagne : Operation.vessel (OPERATION.VESSEL_FK).

Autres caractéristiques > Engin

 

Liste.

Choix parmi les engins de la campagne

Operation.gearPhysicialFeatures (OPERATION.GEAR_PHYSCIAL_FEATURES_FK) : lien vers un engin déjà déclaré au niveau de la campagne. Le code de l'engin est également dupliqué au début de Operation.name (OPERATION.NAME), devant le numéro du trait, pour rester compatible avec le format des données historiques.

Autres caractéristiques > Navire(s) associé(s)

 

Liste.

Choix parmi les navires existants en base

Navire dont le code est OPERATION_VESSEL_ASSOCIATION.VESSEL_FK avec !OPERATION_VESSEL_ASSOCIATION.IS_CATCH_ON_OPERATION_VESSEL et OPERATION_VESSEL_ASSOCIATION.OPERATION_FK = OperationId

Commentaire

 

 

Operation.comments (OPERATION.COMMENTS)

Pièces Jointes

 

 

Chaque pièce jointes est stockée dans MeasurementFile (MEASUREMENT_FILE avec PMFM_FK=null, OBJECT_TYPE_FK='OPERATION' et OBJECT_ID=<ID du trait>) MeasurementFile.path : chemin du fichier (copier dans un répertoire, puis stocké en relatif) MeasurementFile.name : nom MeasurementFile.comments : commentaire

Trait > Mise en oeuvre de l'engin

Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Valeur

Type de la caractéristique issu d'un référentiel

gearUseFeatures.gearUseMeasurement (GEAR_USE_MEASUREMENT.xxx - en fonction du type de PSFM : NUMERICAL_VALUE, ALPHANUMERICAL_VALUE ou QUALITATIVE_VALUE_FK)

avec gearUseFeatures.operation.id = <OperationId>

Trait > Autres paramètres

Cet onglet permet la saisie des paramètres d'hydrologie et des paramètres environnementaux.

Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Valeur

Type de la caractéristique issu d'un référentiel

vesselUseFeatures.vesselUseMeasurement (VESSEL_USE_MEASUREMENT.xxx - en fonction du type de PSFM : NUMERICAL_VALUE, ALPHANUMERICAL_VALUE ou QUALITATIVE_VALUE_FK

avec vesselUseFeatures.operation.id = <OperationId>

Captures

Captures > Résumé

Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Capture > Poids TOTAL (1)

 

Numérique

Lot "Capture" (BATCH avec IS_CATCH_BATCH=1)

Capture > Poids total VRAC (2)

 

Numérique (Lecture seule)

Non persisté.

Capture > Poids total HORS VRAC (2)

 

Numérique (Lecture seule)

Non persisté.

Capture > Poids total NON TRIE (3)

 

Numérique

Lot "Capture > Non trié"

Capture > Carroussel observé (3)

Numérique (Lecture seule) Importé via l'import Pupitri.
Lot "Capture > Vrac"

Capture > Trémie (1)

Numérique (Lecture seule) Importé via l'import Pupitri.
Lot "Capture > Vrac" (poids avant élévation) (uniquement conservé dans le champs SortingBatch.samplingRatioText) et utilisé pour le calcul de SortingBatch.samplingRatio

Espèce > Poids TOTAL (2)

 

Numérique

Non persisté.

Espèce > Poids total VRAC (1)

 

Numérique

Lot "Capture > Vrac > Espèce"

Espèce > Poids total VRAC trié (2)

 

Numérique

Non persisté.

Espèce > Poids total HORS VRAC (2)

 

Numérique

Non persisté.

Benthos > Poids TOTAL (2)

 

Numérique

Non persisté.

Benthos > Poids total VRAC (1)

 

Numérique

Lot "Capture > Vrac > Benthos"

Benthos > Poids total VRAC trié (2)

 

Numérique

Non persisté.

Benthos > Poids total HORS VRAC (2)

 

Numérique

Non persisté.

Macro-déchets > Poids total (1)

 

Numérique

Lot "Capture > Hors Vrac > Macro-déchets"

Pièces Jointes

 

 

Chaque pièce jointes est stockée dans MeasurementFile (MEASUREMENT_FILE avec PMFM_FK=null, OBJECT_TYPE_FK='CATCH_BATCH' et OBJECT_ID=<ID du lot de la capture>) MeasurementFile.path : chemin du fichier (copier dans un répertoire, puis stocké en relatif) MeasurementFile.name : nom MeasurementFile.comments : commentaire

(1) Uniquement persisté si non calculé.
CatchBatch.quantificationMeasurement.numericalValue (QUANTIFICATION_MEASUREMENT.NUMERICAL_VALUE avec IS_REFERENT=1 et PMFM_FK=<PmfmId.WEIGHT_OBSERVED>)

(2) Non persisté, calculé via l'élévation des poids.

(3) Uniquement si le navire possède un carrousel et un trémie (i.e navire de la campagne est celui défini dans la configuration).

Captures > Espèces

Cartouche du haut

Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Poids total (1)

Numérique (Lecture seule)

Non stocké en base.

Poids total VRAC (2) (3)

 

Numérique.

Lot "Capture > Vrac > Espèce"

Poids VRAC trié (1)

Numérique (Lecture seule)

Non stocké en base.

Poids total HORS VRAC (1)

Numérique (Lecture seule)

Non stocké en base.

Poids inerte trié (2)

 

Numérique

Lot "Capture > Vrac > Espèce > Inert (not alive)" (2)

Poids vivant non détaillé trié (2)

 

Numérique

Lot "Capture > Vrac > Espèce > Alive not itemized" (2)

(1) Non persisté, calculé via l'élévation des poids.

(2) Uniquement persisté si non calculé.
CatchBatch.quantificationMeasurement.numericalValue (QUANTIFICATION_MEASUREMENT.NUMERICAL_VALUE avec IS_REFERENT=1 et PMFM_FK=<PmfmId.WEIGHT_OBSERVED>)

(3) Le plus souvent, ce poids sera similaire au poids VRAC trié Espèces et sera donc calculé. Cependant, si seule une fraction des espèces est observée, renseigner ici le poids d'élévation.

Tableau

Chaque ligne du tableau est stockée sous la forme d'un lot (Batch) positionné selon le caractère V ou H/V
Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Tableau > Espèce du lot

X

 

stockage de l'espèce uniquement pour les lot parent Batch.referenceTaxon (BATCH.REFERENCE_TAXON_FK)

Tableau > V/HV

X

Vrac ou Hors Vrac : Batch.sortingMeasurement.qualitativeValue (SORTING_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId.SORTED_UNSORTED>) Poids : Batch.quantificationMeasurement.numericalValue (QUANTIFICATION_MEASUREMENT.NUMERICAL_VALUE avec IS_REFERENT=1 et PMFM_FK=<PmfmId.WEIGHT_OBSERVED>)

si Batch.weightBeforeSampling == null, Batch.weight, sinon Batch.weightBeforeSampling

Tableau > Class. Tri

 

 

Batch.sortingMeasurement.qualitativeValue (SORTING_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId.SIZE_CATEGORY>)

si Batch.weightBeforeSampling == null, Batch.weight, sinon Batch.weightBeforeSampling

Tableau > Sexe

 

 

Batch.sortingMeasurement.qualitativeValue (SORTING_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId.SEX>)

si Batch.weightBeforeSampling == null, Batch.weight, sinon Batch.weightBeforeSampling

Tableau > Maturité

 

 

Batch.sortingMeasurement.qualitativeValue (SORTING_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId.MATURITY>)

si Batch.weightBeforeSampling == null, Batch.weight, sinon Batch.weightBeforeSampling

Tableau > Age

 

 

Batch.sortingMeasurement.numericalValue (SORTING_MEASUREMENT.NUMERICAL_VALUE avec PMFM_FK=<PmfmId.AGE>)

si Batch.weightBeforeSampling == null, Batch.weight, sinon Batch.weightBeforeSampling

Tableau > Poids sous‑échantillonné

 

Numérique

Batch.weight (uniquement renseigné si Batch.weightBeforeSampling !=null)

Tableau > Nombre

 

 

Calculé à partir de la somme du nombre d'individus des lots fils (BATCH.INDIVIDUAL_COUNT avec PARENT_BATCH_FK=<ID du lot de la ligne du tableau>) (voir ci-dessous "Mensuration > Tableau")

Tableau > Commentaire

 

Texte libre

Batch.comments

Tableau > Pièces Jointes

 

Fichier

Chaque pièce jointes est stockée dans MeasurementFile (MEASUREMENT_FILE avec PMFM_FK=null, OBJECT_TYPE_FK='SAMPLE' et OBJECT_ID=<ID du lot de la ligne du tableau>) MeasurementFile.path : chemin du fichier (copier dans un répertoire, puis stocké en relatif ?) MeasurementFile.name : nom MeasurementFile.comments : commentaire

Tableau > A confirmer

Booléen (Case à cocher)

Si coché Batch.Quality = QUALITY_FLAG_CODE_DOUBTFUL,
sinon Batch.Quality = QUALITY_FLAG_CODE_NOT_QUALIFIED

Mensurations

Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Mensuration > Type de mesure

Dupliqué pour chaque lot de mensuration créé (un lot pour chaque taille saisie) Batch.sortingMeasurement.pmfm (SORTING_MEASUREMENT.PMFM_FK)

Mensuration > Pas de la classe de taille

Non stocké en base.

Mensuration > Tableau

Chaque ligne du tableau de mensuration est stocké sous la forme d'un lot relié au lot correspondant à la ligne parent du tableau des espèces. (BATCH avec PARENT_BATCH_FK=<ID du lot parent dans le tableau des espèces>)

Mensuration > Tableau > Classe de taille

Batch.sortingMeasurement.numericalValue (SORTING_MEASUREMENT.NUMERICAL_VALUE avec PMFM_FK=<ID correspondant au "Type de mesure">)

Mensuration > Tableau > Nombre

Batch.individualCount (BATCH.INDIVIDUAL_COUNT)

Mensuration > Tableau > Poids observé

Batch.quantificationMeasurement.numericalValue (QUANTIFICATION_MEASUREMENT.NUMERICAL_VALUE avec IS_REFERENT=1)

Captures > Benthos

Cartouche du haut

Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Poids total (1)

Numérique (Lecture seule)

Non stocké en base.

Poids total VRAC (2) (3)

 

Numérique.

Lot "Capture > Vrac > Benthos"

Poids VRAC trié (1)

Numérique (Lecture seule)

Non stocké en base.

Poids total HORS VRAC (1)

Numérique (Lecture seule)

Non stocké en base.

Poids inerte trié (2)

 

Numérique

Lot "Capture > Vrac > Benthos > Inert (not alive)"

Poids vivant non détaillé trié (2)

 

Numérique

Lot "Capture > Vrac > Benthos > Alive not itemized"

(1) Non persisté, calculé via l'élévation des poids.

(2) Uniquement persisté si non calculé.
CatchBatch.quantificationMeasurement.numericalValue (QUANTIFICATION_MEASUREMENT.NUMERICAL_VALUE avec IS_REFERENT=1 et PMFM_FK=<PmfmId.WEIGHT_OBSERVED>)

(3) Le plus souvent, ce poids sera similaire au poids VRAC trié Benthos et sera donc calculé. Cependant, si seule une fraction des espèces est observée, renseigner ici le poids d'élévation.

Tableau

Chaque ligne du tableau est stockée sous la forme d'un lot (Batch) positionné selon le caractère V ou H/V
Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Tableau > Espèce du lot

X

 

stockage de l'espèce uniquement pour les lot parent Batch.referenceTaxon (BATCH.REFERENCE_TAXON_FK)

Tableau > V/HV

X

Vrac ou Hors Vrac : Batch.sortingMeasurement.qualitativeValue (SORTING_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId.SORTED_UNSORTED>) Poids : Batch.quantificationMeasurement.numericalValue (QUANTIFICATION_MEASUREMENT.NUMERICAL_VALUE avec IS_REFERENT=1 et PMFM_FK=<PmfmId.WEIGHT_OBSERVED>)

si Batch.weightBeforeSampling == null, Batch.weight, sinon Batch.weightBeforeSampling

Tableau > Class. Tri

 

 

Batch.sortingMeasurement.qualitativeValue (SORTING_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId.SIZE_CATEGORY>)

si Batch.weightBeforeSampling == null, Batch.weight, sinon Batch.weightBeforeSampling

Tableau > Sexe

 

 

Batch.sortingMeasurement.qualitativeValue (SORTING_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId.SEX>)

si Batch.weightBeforeSampling == null, Batch.weight, sinon Batch.weightBeforeSampling

Tableau > Maturité

 

 

Batch.sortingMeasurement.qualitativeValue (SORTING_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId.MATURITY>)

si Batch.weightBeforeSampling == null, Batch.weight, sinon Batch.weightBeforeSampling

Tableau > Age

 

 

Batch.sortingMeasurement.numericalValue (SORTING_MEASUREMENT.NUMERICAL_VALUE avec PMFM_FK=<PmfmId.AGE>)

si Batch.weightBeforeSampling == null, Batch.weight, sinon Batch.weightBeforeSampling

Tableau > Poids sous‑échantillonné

 

Numérique

Batch.weight (uniquement renseigné si Batch.weightBeforeSampling !=null)

Tableau > Nombre

 

 

Calculé à partir de la somme du nombre d'individus des lots fils (BATCH.INDIVIDUAL_COUNT avec PARENT_BATCH_FK=<ID du lot de la ligne du tableau>) (voir ci-dessous "Mensuration > Tableau")

Tableau > Commentaire

 

Texte libre

Batch.comments

Tableau > Pièces Jointes

 

Fichier

Chaque pièce jointes est stockée dans MeasurementFile (MEASUREMENT_FILE avec PMFM_FK=null, OBJECT_TYPE_FK='SAMPLE' et OBJECT_ID=<ID du lot de la ligne du tableau>) MeasurementFile.path : chemin du fichier (copier dans un répertoire, puis stocké en relatif) MeasurementFile.name : nom MeasurementFile.comments : commentaire

Tableau > A confirmer

 

Booléen (Case à cocher)

Si coché Batch.Quality = QUALITY_FLAG_CODE_DOUBTFUL,
sinon Batch.Quality = QUALITY_FLAG_CODE_NOT_QUALIFIED

Mensurations

Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Mensuration > Type de mesure

Dupliqué pour chaque lot de mensuration créé (un lot pour chaque taille saisie) Batch.sortingMeasurement.pmfm (SORTING_MEASUREMENT.PMFM_FK)

Mensuration > Pas de la classe de taille

Non stocké en base.

Mensuration > Tableau

Chaque ligne du tableau de mensuration est stocké sous la forme d'un lot relié au lot correspondant à la ligne parent du tableau des espèces. (BATCH avec PARENT_BATCH_FK=<ID du lot parent dans le tableau des espèces>)

Mensuration > Tableau > Classe de taille

Batch.sortingMeasurement.numericalValue (SORTING_MEASUREMENT.NUMERICAL_VALUE avec PMFM_FK=<ID correspondant au "Type de mesure">)

Mensuration > Tableau > Nombre

Batch.individualCount (BATCH.INDIVIDUAL_COUNT)

Mensuration > Tableau > Poids observé

Batch.quantificationMeasurement.numericalValue (QUANTIFICATION_MEASUREMENT.NUMERICAL_VALUE avec IS_REFERENT=1)

Captures > Macro déchets

Cartouche du haut

Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Macro-dechets > Poids total

 

Numérique

Lot "Capture > Hors Vrac > Macro déchets" Batch.quantificationMeasurement.numericalValue (QUANTIFICATION_MEASUREMENT.NUMERICAL_VALUE avec IS_REFERENT=1 et PMFM_FK=<PmfmId.WEIGHT_OBSERVED>)

Tableau

Chaque ligne du tableau est stockée sous la forme d'un lot (Batch) positionné sous le lot "Capture > Hors Vrac > Macro-déchets".

Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Tableau > Catégorie de déchets

X

Choix parmi les valeurs issues d'un référentiel

Batch.sortingMeasurement.qualitativeValue (SORTING_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId.MARINE_LITTER_TYPE>)

Tableau > Catégorie de taille

X

Choix parmi les valeurs issues d'un référentiel

Batch.sortingMeasurement.qualitativeValue (SORTING_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId.MARINE_LITTER_SIZE_CATEGORY>)

Tableau > Nombre

X

Numérique

Batch.quantificationMeasurement.qualitativeValue (QUANTIFICATION_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId.SIZE_CATEGORY>)

Tableau > Poids

 

Numérique

Batch.individualCount

Tableau > Commentaire

 

Texte libre

Batch.comments

Tableau > Pièces Jointes

 

Fichier

Chaque pièce jointes est stockée dans MeasurementFile (MEASUREMENT_FILE avec PMFM_FK=null, OBJECT_TYPE_FK='SAMPLE' et OBJECT_ID=<ID du lot de la ligne du tableau>) MeasurementFile.path : chemin du fichier (copier dans un répertoire, puis stocké en relatif) MeasurementFile.name : nom MeasurementFile.comments : commentaire

Captures > Observations individuelles

Chaque ligne du tableau est stockée sous la forme d'un prélèvement (Sample) attaché à un lot.

Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Tableau > Espèce

X

Liste.

Choix parmi les valeurs issues d'un référentiel

Sample.referenceTaxon

Tableau > Poids (kg)

 

Numérique

Sample.sampleMeasurements.numericalValue (SAMPLE_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId.PMFM_ID_WEIGHT_MEASURED>)

Tableau > Taille

 

Numérique

Sample.sampleMeasurements.numericalValue (SAMPLE_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<Celui de la classe de taille>)

Tableau > Classe de taille

 

Liste.

Choix parmi les caractéristiques du protocole

Sample.sampleMeasurements.qualitativeValue (SAMPLE_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=(celui choisi))

Tableau > ...(1)

 

Liste.

Choix parmi les valeurs issues d'un référentiel

Sample.sampleMeasurements.qualitativeValue (SAMPLE_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<(celui choisi)>)

Tableau > Autres caractéristiques

 

Liste

Choix parmi les caractéristiques existantes en base

Tableau avec une entrée dans Sample.sampleMeasurements pour le pmfm choisi

Tableau > Commentaire

 

Texte libre

Sample.comments

Tableau > Pièces Jointes

 

Fichier

Chaque pièce jointes est stockée dans MeasurementFile (MEASUREMENT_FILE avec PMFM_FK=null, OBJECT_TYPE_FK='SAMPLE' et OBJECT_ID=<ID du lot de la ligne du tableau>) MeasurementFile.path : chemin du fichier (copier dans un répertoire, puis stocké en relatif) MeasurementFile.name : nom MeasurementFile.comments : commentaire

(1) Pour toute caractéristique renseignée dans le protocole "Caractéristiques > Observations individuelles", on aura une colonne

Captures > Captures accidentelles

Chaque ligne du tableau est stockée sous la forme d'un prélèvement (Sample) non attaché à un lot.

Libellé de l'élément Obligatoire Type Correspondance en base de données

Tableau > Espèce

X

Liste.

Choix parmi les valeurs issues d'un référentiel

Sample.referenceTaxon

Tableau > Sexe

 

 

Sample.sampleMeasurements.qualitativeValue (SAMPLE_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId.SEX>)

Tableau > Poids (kg)

 

Numérique

Sample.sampleMeasurements.numericalValue (SAMPLE_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId.PMFM_ID_WEIGHT_MEASURED>)

Tableau > Taille

 

Numérique

Sample.sampleMeasurements.numericalValue (SAMPLE_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId de la classe de taille.>)

Tableau > Classe de taille

 

Liste.

Choix parmi les caractéristiques du protocole

Sample.sampleMeasurements.qualitativeValue (SAMPLE_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId.>)

Tableau > Mort ou vivant

 

Liste.

Choix parmi les valeurs issues d'un référentiel

Sample.sampleMeasurements.qualitativeValue (SAMPLE_MEASUREMENT.QUALITATIVE_VALUE_FK avec PMFM_FK=<PmfmId.>)

Tableau > Autres caractéristiques

 

Liste

Choix parmi les caractéristiques existantes en base

Tableau avec une entrée dans Sample.sampleMeasurements pour le pmfm choisi

Tableau > Commentaire

 

Texte libre

Sample.comments

Tableau > Pièces Jointes

 

Fichier

Chaque pièce jointes est stockée dans MeasurementFile (MEASUREMENT_FILE avec PMFM_FK=null, OBJECT_TYPE_FK='SAMPLE' et OBJECT_ID=<ID du lot de la ligne du tableau>) MeasurementFile.path : chemin du fichier (copier dans un répertoire, puis stocké en relatif) MeasurementFile.name : nom MeasurementFile.comments : commentaire

Correspondance des Id et PmfmId

Zone d'étude

LocationLevelId.SCIENTIFIC_CRUISE_PROGRAM=301


Strate

LocationLevelId.SCIENTIFIC_CRUISE_STRATA=302


sous strate

LocationLevelId.SCIENTIFIC_CRUISE_SUB_STRATA=303


localité

LocationLevelId.SCIENTIFIC_CRUISE_LOCALITE=304


radiale

LocationLevelId.SCIENTIFIC_CRUISE_RADIALE=305


Catégorie Sex

PmfmId.SEX=196

QualitativeValueId.SEX_UNDEFINED=299

QualitativeValueId.SEX_MALE=300

QualitativeValueId.SEX_FEMALE=301


Catégorie classe de tri

PmfmId.SIZE_CATEGORY=198

QualitativeValueId.SIZE_SMALL=307

QualitativeValueId.SIZE_MEDIUM=306

QualitativeValueId.SIZE_BIG=305


Catégorie Age

PmfmId.AGE=1430


Catégorie maturité

PmfmId.MATURITY=174

QualitativeValueId.MATURITY_1=272

QualitativeValueId.MATURITY_2=273

QualitativeValueId.MATURITY_3=274

QualitativeValueId.MATURITY_4=275

QualitativeValueId.MATURITY_5=276


Catégorie macro-déchet

PmfmId.MARINE_LITTER_TYPE=1421


Classe de taille macro-déchet

PmfmId.MARINE_LITTER_SIZE_CATEGORY=1422


Pour stocker Cruise.surveyPart

PmfmId.SURVEY_PART=1432


PmfmId.STATION_NUMBER=1243

PmfmId.TRAWL_DISTANCE=113


PmfmId.HAUL_VALID=1163

QualitativeValueId.HAUL_VALID_YES=1575

QualitativeValueId.HAUL_VALID_NO=1576


PmfmId.RECTILINEAR_OPERATION=192

QualitativeValueId.RECTILINEAR_OPERATION_YES=277

QualitativeValueId.RECTILINEAR_OPERATION_NO=278


PSFM "Nombre de poche" d'un chalut (écran campagne)

PmfmId.MULTIRIG_NUMBER=1420


PSFM "Liste des poches observées" (écran opération)

PmfmId.MULTIRIG_AGGREGATION=1424


PSFM "Poids - observation par une observateur" (écran captures, onglet espèce, benthos, etc)

PmfmId.WEIGHT_MEASURED=220


PSFM "Vrac/Hors Vrac" - "Organisation des données campagnes"

PmfmId.SORTED_UNSORTED=1428

QualitativeValueId.SORTED_VRAC=311

QualitativeValueId.SORTED_HORS_VRAC=310

QualitativeValueId.UNSORTED=2146


PmfmId.SCIENTIFIC_CRUISE_SORTING_TYPE=1429

QualitativeValueId.SORTING_TYPE_SPECIES=2147

QualitativeValueId.SORTING_TYPE_BENTHOS=2148

QualitativeValueId.SORTING_TYPE_PLANCTON=2149

QualitativeValueId.SORTING_TYPE_MARINE_LITTER=2150

QualitativeValueId.SORTING_TYPE_ACCIDENTAL_CATCH=2151


PmfmId.SCIENTIFIC_CRUISE_SORTING_TYPE_2=1431

QualitativeValueId.SORTING_TYPE_2_ALIVE_NOT_ITEMIZED=2161

QualitativeValueId.SORTING_TYPE_2_INERT=2162

QualitativeValueId.SORTING_TYPE_2_ALIVE_ITEMIZED=2160


PSFM "Ouverture verticale (chalut ou drague)" (pour export operation)

PmfmId.VERTICAL_OPENING=832


PSFM "Ouverture Horizontale aux pointes d'ailes" (pour export operation)

PmfmId.HORIZONTAL_OPENING_WING=827


PSFM "Ouverture horizontale aux panneaux" (pour export operation)

PmfmId.HORIZONTAL_OPENING_DOOR=830


PSFM "Remis à l'eau mort ou vivant"

PmfmId.DEAD_OR_ALIVE=1393


PSFM "Pour référencer un autre id de pmfm"

PmfmId.ID_PMFM=1433

PmfmId.SAMPLE_ID=1435

PmfmId.OTOLITHE_ID=1436


(20=observateur volant, 95=Administrateur SIH) -> L'avantage du 20 est qu'il est inactif (=20), donc plus facilement detectable PersonId.UNKNOWN_RECORDER_PERSON=20


DepartmentCode.INSIDE_PREFIX=PDG-


DepartmentId.UNKNOWN_RECORDER_DEPARTMENT=181 (à confirmer par Vincent)


ProgramCode.SCIENTIFIC_CRUISE_PREFIX=CAM-

ObjectTypeCode.SCIENTIFIC_CRUISE=SCIENTIFIC_CRUISE

ObjectTypeCode.OPERATION=OPERATION

ObjectTypeCode.CATCH_BATCH=CATCH_BATCH

ObjectTypeCode.BATCH=BATCH

ObjectTypeCode.SAMPLE=SAMPLE


VesselPersonRoleId.SCIENTIFIC_CRUISE_MANAGER=2

VesselPersonRoleId.SORT_ROOM_MANAGER=3

VesselPersonRoleId.RECORDER_PERSON=4


TranscribingTypeId.TAXINOMIE_REFTAX_MNEMONIQUE=55

TranscribingTypeId.TAXINOMIE_COMMUN_NOM_VERNACULAIRE=56


MatrixId.PRODUCT_BATCH=1